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GenBank: BX005252.15
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LOCUS BX005252 164957 bp DNA linear VRT 05-MAR-2015 DEFINITION Zebrafish DNA sequence from clone DKEY-192P21 in linkage group 13, complete sequence. ACCESSION BX005252 VERSION BX005252.15 DBLINK BioSample: SAMEA3146246 KEYWORDS HTG. SOURCE Danio rerio (zebrafish) ORGANISM Danio rerio Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Actinopterygii; Neopterygii; Teleostei; Ostariophysi; Cypriniformes; Danionidae; Danioninae; Danio. REFERENCE 1 (bases 1 to 164957) AUTHORS Martin,S. CONSRTM Genome Reference Consortium TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (13-DEC-2012) Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Cambridgeshire, CB10 1SA, UK. E-mail enquiries: grc-help@sanger.ac.uk Clone requests: http://www.sanger.ac.uk/Projects/D_rerio/faqs.shtml#dataeight COMMENT On Mar 26, 2004 this sequence version replaced BX005252.14. -------------- Genome Center Center: Wellcome Trust Sanger Institute Center code: SC Web site: http://www.sanger.ac.uk Contact: grc-help@sanger.ac.uk -------------- This sequence was finished as follows unless otherwise noted: all regions were either double-stranded or sequenced with an alternate chemistry or covered by high quality data (i.e., phred quality >= 30); an attempt was made to resolve all sequencing problems, such as compressions and repeats; all regions were covered by at least one subclone; and the assembly was confirmed by restriction digest, except on the rare occasion of the clone being a YAC. Clone-derived Zebrafish pUC subclones occasionally display inconsistency over the length of mononucleotide A/T runs and conserved TA repeats. Where this is found the longest good quality representation will be submitted. Any regions longer than 1kb tagged as misc-feature 'unsure' are part of a tandem repeat of more than 10kb in length where it has not been possible to anchor the base differences between repeat copies. The region has been built up based on the repeat element to match the total size of repeat indicated by restriction digest, but repeat copies may not be in the correct order and the usual finishing criteria may not apply. DKEY-192P21 is from a Zebrafish BAC library VECTOR: pIndigoBAC-5. FEATURES Location/Qualifiers source 1..164957 /organism="Danio rerio" /mol_type="genomic DNA" /db_xref="taxon:7955" /chromosome="13" /clone="DKEY-192P21" /clone_lib="DanioKey" misc_feature 63008 /note="Tandem repeat. Forced join. Assembly confirmed by restriction digest data." ORIGIN 1 aagcttggcg caagagtcgt tttgaagcgt tgcgctacgc tgtttaaata gcaaatgcat 61 tagcgctcat atgtgcgtcc ataggcgttc tggtctaaaa aggaaggcgt tctgaggcgg 121 accgctggcg cattgctatt ttgagaaacc ataatagatt tttcattaga ccaaaacaaa 181 cctggtctaa actcaggcgc agagttgcgc ctcgcttacg cactgcttaa tacacacaag 241 agagcaatat gcaaatatct ttacatatga aaaaatgtaa atattaagga tatatatagg 301 atataataag aatagatata agatataaat ataaaggatt aaaatattac gaaacatatt 361 attttctagc ctatataaat atgaaaaacc actgctttta tgtcttcttc atctcgggag 421 gctttttcag ttcattcata acaatttgct tttgtataat ggtattatta gcagtattat 481 ttattatatt catatttata tttgttttat taaaaacaag cttagatttg cccacctgtc 541 aggttttaga ccatatgagg cacagcatgt gttttaggat ataactcagg tttttgagca 601 cattttgtta ttattattat ttattaattc gtttgctgga aattagaact gaatttagaa 661 atagttttga aacgaatatt tgcgcttaac aaacaaaagt atttatttat aaactaatta 721 atgtctttgc gtaaaggttt ccctatccga gagcgaaagt gaaagtgatc cattatctct 781 aattctcaca cagtagatgc tctgtttaac agttttctgt taaataaact gtcaactgtt 841 aactgtttgc 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