Name: rs11404416
Published: September 21, 2022
License: Open Access

Welcome to the Reference SNP (rs) Report

All alleles are reported in the Forward orientation. Click on the Variant Details tab for details on Genomic Placement, Gene, and Amino Acid changes. HGVS names are in the HGVS tab.

Reference SNP (rs) Report

This page reports data for a single dbSNP Reference SNP variation (RefSNP or rs) from the new redesigned dbSNP build.
Top of the page reports a concise summary for the rs, with more specific details included in the corresponding tabs below.
All alleles are reported in the Forward orientation. Use the Genomic View to inspect the nucleotides flanking the variant, and its neighbors.
For more information see Help documentation.

rs11404416

Current Build 156

Released September 21, 2022

Organism: Homo sapiens
Position: chr1:212597420-212597451 (GRCh38.p14) Help
The anchor position for this RefSNP. Includes all nucleotides potentially affected by this change, thus it can differ from HGVS, which is right-shifted. See here for details.
Alleles: del(TATC)₄ / del(TATC)₃ / del(TATC…
del(TATC)₄ / del(TATC)₃ / del(TATC)₂ / delTATC / dupTATC / dup(TATC)₂ / dup(TATC)₃ / dup(TATC)₄ / dup(TATC)₅ / dup(TATC)₆
Variation Type: Indel Insertion and Deletion
Frequency: (TATC)₈=0.3689 (1976/5356, ALFA)
(TATC)₈=0.2885 (1445/5008, 1000G)

Clinical Significance: Not Reported in ClinVar
Gene : Consequence: ATF3 : Intron Variant
Publications: 0 citations
Genomic View: See rs on genome

ALFA Allele Frequency
The ALFA project provide aggregate allele frequency from dbGaP. More information is available on the project page including descriptions, data access, and terms of use.

Release Version: 20231103111315

Population	Group	Sample Size	Ref Allele	Alt Allele	Ref HMOZ	Alt HMOZ	HTRZ	HWEP
Total	Global	5356	TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.3689	TATCTATCTATCTATC=0.0000, TATCTATCTATCTATCTATC=0.0000, TATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0000, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.4380, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.1060, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0375, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0284, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0196, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0015, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0000	0.319797	0.339538	0.340666	32
European	Sub	5138	TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.3437	TATCTATCTATCTATC=0.0000, TATCTATCTATCTATCTATC=0.0000, TATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0000, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.4556, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.1104, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0389, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0294, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0204, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0016, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0000	0.277311	0.360144	0.362545	32
African	Sub	128	TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=1.000	TATCTATCTATCTATC=0.000, TATCTATCTATCTATCTATC=0.000, TATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.000, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.000, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.000, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.000, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.000, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.000, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.000, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.000	1.0	0.0	0.0	N/A
African Others	Sub	6	TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=1.0	TATCTATCTATCTATC=0.0, TATCTATCTATCTATCTATC=0.0, TATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0	1.0	0.0	0.0	N/A
African American	Sub	122	TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=1.000	TATCTATCTATCTATC=0.000, TATCTATCTATCTATCTATC=0.000, TATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.000, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.000, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.000, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.000, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.000, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.000, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.000, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.000	1.0	0.0	0.0	N/A
Asian	Sub	0	TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0	TATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0	0	0	0	N/A
East Asian	Sub	0	TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0	TATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0	0	0	0	N/A
Other Asian	Sub	0	TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0	TATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0	0	0	0	N/A
Latin American 1	Sub	14	TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=1.00	TATCTATCTATCTATC=0.00, TATCTATCTATCTATCTATC=0.00, TATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.00, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.00, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.00, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.00, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.00, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.00, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.00, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.00	1.0	0.0	0.0	N/A
Latin American 2	Sub	36	TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=1.00	TATCTATCTATCTATC=0.00, TATCTATCTATCTATCTATC=0.00, TATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.00, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.00, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.00, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.00, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.00, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.00, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.00, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.00	1.0	0.0	0.0	N/A
South Asian	Sub	8	TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=1.0	TATCTATCTATCTATC=0.0, TATCTATCTATCTATCTATC=0.0, TATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.0	1.0	0.0	0.0	N/A
Other	Sub	32	TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.75	TATCTATCTATCTATC=0.00, TATCTATCTATCTATCTATC=0.00, TATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.00, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.16, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.03, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.03, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.03, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.00, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.00, TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC=0.00	0.857143	0.142857	0.0	8

Frequency tab displays a table of the reference and alternate allele frequencies reported by various studies and populations. Table lines, where Population="Global" refer to the entire study population, whereas lines, where Group="Sub", refer to a study-specific population subgroupings (i.e. AFR, CAU, etc.), if available. Frequency for the alternate allele (Alt Allele) is a ratio of samples observed-to-total, where the numerator (observed samples) is the number of chromosomes in the study with the minor allele present (found in "Sample size", where Group="Sub"), and the denominator (total samples) is the total number of all chromosomes in the study for the variant (found in "Sample size", where Group="Study-wide" and Population="Global").

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Study	Population	Group	Sample Size	Ref Allele	Alt Allele
Allele Frequency Aggregator	Total	Global	5356	(TATC)₈=0.3689	del(TATC)₄=0.0000, del(TATC)₃=0.0000, del(TATC)₂=0.0000, delTATC=0.4380, dupTATC=0.0284, dup(TATC)₂=0.1060, dup(TATC)₃=0.0375, dup(TATC)₄=0.0196, dup(TATC)₅=0.0015, dup(TATC)₆=0.0000
Allele Frequency Aggregator	European	Sub	5138	(TATC)₈=0.3437	del(TATC)₄=0.0000, del(TATC)₃=0.0000, del(TATC)₂=0.0000, delTATC=0.4556, dupTATC=0.0294, dup(TATC)₂=0.1104, dup(TATC)₃=0.0389, dup(TATC)₄=0.0204, dup(TATC)₅=0.0016, dup(TATC)₆=0.0000
Allele Frequency Aggregator	African	Sub	128	(TATC)₈=1.000	del(TATC)₄=0.000, del(TATC)₃=0.000, del(TATC)₂=0.000, delTATC=0.000, dupTATC=0.000, dup(TATC)₂=0.000, dup(TATC)₃=0.000, dup(TATC)₄=0.000, dup(TATC)₅=0.000, dup(TATC)₆=0.000
Allele Frequency Aggregator	Latin American 2	Sub	36	(TATC)₈=1.00	del(TATC)₄=0.00, del(TATC)₃=0.00, del(TATC)₂=0.00, delTATC=0.00, dupTATC=0.00, dup(TATC)₂=0.00, dup(TATC)₃=0.00, dup(TATC)₄=0.00, dup(TATC)₅=0.00, dup(TATC)₆=0.00
Allele Frequency Aggregator	Other	Sub	32	(TATC)₈=0.75	del(TATC)₄=0.00, del(TATC)₃=0.00, del(TATC)₂=0.00, delTATC=0.16, dupTATC=0.03, dup(TATC)₂=0.03, dup(TATC)₃=0.03, dup(TATC)₄=0.00, dup(TATC)₅=0.00, dup(TATC)₆=0.00
Allele Frequency Aggregator	Latin American 1	Sub	14	(TATC)₈=1.00	del(TATC)₄=0.00, del(TATC)₃=0.00, del(TATC)₂=0.00, delTATC=0.00, dupTATC=0.00, dup(TATC)₂=0.00, dup(TATC)₃=0.00, dup(TATC)₄=0.00, dup(TATC)₅=0.00, dup(TATC)₆=0.00
Allele Frequency Aggregator	South Asian	Sub	8	(TATC)₈=1.0	del(TATC)₄=0.0, del(TATC)₃=0.0, del(TATC)₂=0.0, delTATC=0.0, dupTATC=0.0, dup(TATC)₂=0.0, dup(TATC)₃=0.0, dup(TATC)₄=0.0, dup(TATC)₅=0.0, dup(TATC)₆=0.0
Allele Frequency Aggregator	Asian	Sub	0	(TATC)₈=0	del(TATC)₄=0, del(TATC)₃=0, del(TATC)₂=0, delTATC=0, dupTATC=0, dup(TATC)₂=0, dup(TATC)₃=0, dup(TATC)₄=0, dup(TATC)₅=0, dup(TATC)₆=0
1000Genomes	Global	Study-wide	5008	(TATC)₈=0.2885	delTATC=0.7115
1000Genomes	African	Sub	1322	(TATC)₈=0.3828	delTATC=0.6172
1000Genomes	East Asian	Sub	1008	(TATC)₈=0.0942	delTATC=0.9058
1000Genomes	Europe	Sub	1006	(TATC)₈=0.3459	delTATC=0.6541
1000Genomes	South Asian	Sub	978	(TATC)₈=0.286	delTATC=0.714
1000Genomes	American	Sub	694	(TATC)₈=0.311	delTATC=0.689

Variant Details tab shows known variant placements on genomic sequences: chromosomes (NC_), RefSeqGene, pseudogenes or genomic regions (NG_), and in a separate table: on transcripts (NM_) and protein sequences (NP_). The corresponding transcript and protein locations are listed in adjacent lines, along with molecular consequences from Sequence Ontology. When no protein placement is available, only the transcript is listed. Column "Codon[Amino acid]" shows the actual base change in the format of "Reference > Alternate" allele, including the nucleotide codon change in transcripts, and the amino acid change in proteins, respectively, allowing for known ribosomal slippage sites. To view nucleotides adjacent to the variant use the Genomic View at the bottom of the page - zoom into the sequence until the nucleotides around the variant become visible.

Genomic Placements

Sequence name	Change
GRCh38.p14 chr 1	NC_000001.11:g.212597420TATC[4]
GRCh38.p14 chr 1	NC_000001.11:g.212597420TATC[5]
GRCh38.p14 chr 1	NC_000001.11:g.212597420TATC[6]
GRCh38.p14 chr 1	NC_000001.11:g.212597420TATC[7]
GRCh38.p14 chr 1	NC_000001.11:g.212597420TATC[9]
GRCh38.p14 chr 1	NC_000001.11:g.212597420TATC[10]
GRCh38.p14 chr 1	NC_000001.11:g.212597420TATC[11]
GRCh38.p14 chr 1	NC_000001.11:g.212597420TATC[12]
GRCh38.p14 chr 1	NC_000001.11:g.212597420TATC[13]
GRCh38.p14 chr 1	NC_000001.11:g.212597420TATC[14]
GRCh37.p13 chr 1	NC_000001.10:g.212770762TATC[4]
GRCh37.p13 chr 1	NC_000001.10:g.212770762TATC[5]
GRCh37.p13 chr 1	NC_000001.10:g.212770762TATC[6]
GRCh37.p13 chr 1	NC_000001.10:g.212770762TATC[7]
GRCh37.p13 chr 1	NC_000001.10:g.212770762TATC[9]
GRCh37.p13 chr 1	NC_000001.10:g.212770762TATC[10]
GRCh37.p13 chr 1	NC_000001.10:g.212770762TATC[11]
GRCh37.p13 chr 1	NC_000001.10:g.212770762TATC[12]
GRCh37.p13 chr 1	NC_000001.10:g.212770762TATC[13]
GRCh37.p13 chr 1	NC_000001.10:g.212770762TATC[14]
ATF3 RefSeqGene	NG_029871.1:g.37066TATC[4]
ATF3 RefSeqGene	NG_029871.1:g.37066TATC[5]
ATF3 RefSeqGene	NG_029871.1:g.37066TATC[6]
ATF3 RefSeqGene	NG_029871.1:g.37066TATC[7]
ATF3 RefSeqGene	NG_029871.1:g.37066TATC[9]
ATF3 RefSeqGene	NG_029871.1:g.37066TATC[10]
ATF3 RefSeqGene	NG_029871.1:g.37066TATC[11]
ATF3 RefSeqGene	NG_029871.1:g.37066TATC[12]
ATF3 RefSeqGene	NG_029871.1:g.37066TATC[13]
ATF3 RefSeqGene	NG_029871.1:g.37066TATC[14]

Gene: ATF3, activating transcription factor 3 (plus strand)

Molecule type	Change	Amino acid[Codon]	SO Term
ATF3 transcript variant 3	NM_001030287.4:c.-4-17598… NM_001030287.4:c.-4-17598TATC[4]	N/A	Intron Variant
ATF3 transcript variant 4	NM_001040619.3:c.	N/A	Genic Upstream Transcript Variant
ATF3 transcript variant 5	NM_001206484.3:c.	N/A	Genic Upstream Transcript Variant
ATF3 transcript variant 7	NM_001206486.2:c.	N/A	Genic Upstream Transcript Variant
ATF3 transcript variant 8	NM_001206488.3:c.	N/A	Genic Upstream Transcript Variant
ATF3 transcript variant 1	NM_001674.4:c.	N/A	Genic Upstream Transcript Variant
ATF3 transcript variant X1	XM_005273146.2:c.	N/A	Genic Upstream Transcript Variant
ATF3 transcript variant X2	XM_011509579.2:c.	N/A	Genic Upstream Transcript Variant
ATF3 transcript variant X3	XM_047421211.1:c.	N/A	Genic Upstream Transcript Variant

Clinical Significance tab shows a list of clinical significance entries from ClinVar associated with the variation, per allele. Click on the RCV accession (i.e. RCV000001615.2) or Allele ID (i.e. 12274) to access full ClinVar report.

Not Reported in ClinVar

Aliases tab displays HGVS names representing the variant placements and allele changes on genomic, transcript and protein sequences, per allele. HGVS name is an expression for reporting sequence accession and version, sequence type, position, and allele change. The column "Note" can have two values: "diff" means that there is a difference between the reference allele (variation interval) at the placement reported in HGVS name and the reference alleles reported in other HGVS names, and "rev" means that the sequence of this variation interval at the placement reported in HGVS name is in reverse orientation to the sequence(s) of this variation in other HGVS names not labeled as "rev".

Placement	(TATC)₈=	del(TATC)₄	del(TATC)₃	del(TATC)₂	delTATC	dupTATC	dup(TATC)₂	dup(TATC)₃	dup(TATC)₄	dup(TATC)₅	dup(TATC)₆
GRCh38.p14 chr 1	NC_000001.11:g.212597420_212597451=	NC_000001.11:g.212597420TATC[4]	NC_000001.11:g.212597420TATC[5]	NC_000001.11:g.212597420TATC[6]	NC_000001.11:g.212597420TATC[7]	NC_000001.11:g.212597420TATC[9]	NC_000001.11:g.212597420TATC[10]	NC_000001.11:g.212597420TATC[11]	NC_000001.11:g.212597420TATC[12]	NC_000001.11:g.212597420TATC[13]	NC_000001.11:g.212597420TATC[14]
GRCh37.p13 chr 1	NC_000001.10:g.212770762_212770793=	NC_000001.10:g.212770762TATC[4]	NC_000001.10:g.212770762TATC[5]	NC_000001.10:g.212770762TATC[6]	NC_000001.10:g.212770762TATC[7]	NC_000001.10:g.212770762TATC[9]	NC_000001.10:g.212770762TATC[10]	NC_000001.10:g.212770762TATC[11]	NC_000001.10:g.212770762TATC[12]	NC_000001.10:g.212770762TATC[13]	NC_000001.10:g.212770762TATC[14]
ATF3 RefSeqGene	NG_029871.1:g.37066_37097=	NG_029871.1:g.37066TATC[4]	NG_029871.1:g.37066TATC[5]	NG_029871.1:g.37066TATC[6]	NG_029871.1:g.37066TATC[7]	NG_029871.1:g.37066TATC[9]	NG_029871.1:g.37066TATC[10]	NG_029871.1:g.37066TATC[11]	NG_029871.1:g.37066TATC[12]	NG_029871.1:g.37066TATC[13]	NG_029871.1:g.37066TATC[14]
ATF3 transcript variant 3	NM_001030287.3:c.-4-17598=	NM_001030287.3:c.-4-17598TATC[4]	NM_001030287.3:c.-4-17598TATC[5]	NM_001030287.3:c.-4-17598TATC[6]	NM_001030287.3:c.-4-17598TATC[7]	NM_001030287.3:c.-4-17598TATC[9]	NM_001030287.3:c.-4-17598TATC[10]	NM_001030287.3:c.-4-17598TATC[11]	NM_001030287.3:c.-4-17598TATC[12]	NM_001030287.3:c.-4-17598TATC[13]	NM_001030287.3:c.-4-17598TATC[14]
ATF3 transcript variant 3	NM_001030287.4:c.-4-17598=	NM_001030287.4:c.-4-17598TATC[4]	NM_001030287.4:c.-4-17598TATC[5]	NM_001030287.4:c.-4-17598TATC[6]	NM_001030287.4:c.-4-17598TATC[7]	NM_001030287.4:c.-4-17598TATC[9]	NM_001030287.4:c.-4-17598TATC[10]	NM_001030287.4:c.-4-17598TATC[11]	NM_001030287.4:c.-4-17598TATC[12]	NM_001030287.4:c.-4-17598TATC[13]	NM_001030287.4:c.-4-17598TATC[14]

Submissions tab displays variations originally submitted to dbSNP, now supporting this RefSNP cluster (rs). We display Submitter handle, Submission identifier, Date and Build number, when the submission appeared for the first time. Direct submissions to dbSNP have Submission ID in the form of an ss-prefixed number (ss#). Other supporting variations are listed in the table without ss#.

70 SubSNP, 34 Frequency submissions

No	Submitter	Submission ID	Date (Build)
1	HGSV	ss81540624	Dec 15, 2007 (130)
2	HUMANGENOME_JCVI	ss95254213	Mar 15, 2016 (147)
3	BCMHGSC_JDW	ss103497911	Mar 15, 2016 (147)
4	GMI	ss288088836	May 04, 2012 (137)
5	GMI	ss288088838	Sep 14, 2016 (149)
6	PJP	ss294624170	May 09, 2011 (135)
7	PJP	ss294624171	Aug 21, 2014 (142)
8	1000GENOMES	ss326130297	May 09, 2011 (134)
9	1000GENOMES	ss326135448	Jan 10, 2018 (151)
10	1000GENOMES	ss326177469	Jan 10, 2018 (151)
11	LUNTER	ss551018476	Apr 25, 2013 (138)
12	LUNTER	ss551048526	Apr 25, 2013 (138)
13	LUNTER	ss552841508	Apr 25, 2013 (138)
14	BILGI_BIOE	ss666125854	Apr 25, 2013 (138)
15	1000GENOMES	ss1367990463	Aug 21, 2014 (142)
16	DDI	ss1536263783	Apr 01, 2015 (144)
17	SWEGEN	ss2988402336	Nov 08, 2017 (151)
18	MCHAISSO	ss3063625014	Jan 10, 2018 (151)
19	MCHAISSO	ss3064442651	Jan 10, 2018 (151)
20	MCHAISSO	ss3065348687	Jan 10, 2018 (151)
21	URBANLAB	ss3646880504	Oct 11, 2018 (152)
22	KHV_HUMAN_GENOMES	ss3800304359	Jul 12, 2019 (153)
23	KHV_HUMAN_GENOMES	ss3800304360	Jul 12, 2019 (153)
24	KHV_HUMAN_GENOMES	ss3800304361	Jul 12, 2019 (153)
25	KHV_HUMAN_GENOMES	ss3800304362	Jul 12, 2019 (153)
26	KHV_HUMAN_GENOMES	ss3800304363	Jul 12, 2019 (153)
27	EVA	ss3826628081	Apr 25, 2020 (154)
28	EVA	ss3836714929	Apr 25, 2020 (154)
29	EVA	ss3842126555	Apr 25, 2020 (154)
30	KOGIC	ss3946437389	Apr 25, 2020 (154)
31	KOGIC	ss3946437390	Apr 25, 2020 (154)
32	KOGIC	ss3946437391	Apr 25, 2020 (154)
33	KOGIC	ss3946437392	Apr 25, 2020 (154)
34	KOGIC	ss3946437393	Apr 25, 2020 (154)
35	KOGIC	ss3946437394	Apr 25, 2020 (154)
36	GNOMAD	ss4010794662	Apr 25, 2021 (155)
37	GNOMAD	ss4010794663	Apr 25, 2021 (155)
38	GNOMAD	ss4010794664	Apr 25, 2021 (155)
39	GNOMAD	ss4010794665	Apr 25, 2021 (155)
40	GNOMAD	ss4010794666	Apr 25, 2021 (155)
41	GNOMAD	ss4010794667	Apr 25, 2021 (155)
42	GNOMAD	ss4010794668	Apr 25, 2021 (155)
43	GNOMAD	ss4010794669	Apr 25, 2021 (155)
44	GNOMAD	ss4010794670	Apr 25, 2021 (155)
45	TOMMO_GENOMICS	ss5148301264	Apr 25, 2021 (155)
46	TOMMO_GENOMICS	ss5148301265	Apr 25, 2021 (155)
47	TOMMO_GENOMICS	ss5148301266	Apr 25, 2021 (155)
48	TOMMO_GENOMICS	ss5148301267	Apr 25, 2021 (155)
49	TOMMO_GENOMICS	ss5148301268	Apr 25, 2021 (155)
50	TOMMO_GENOMICS	ss5148301269	Apr 25, 2021 (155)
51	1000G_HIGH_COVERAGE	ss5245695354	Oct 12, 2022 (156)
52	1000G_HIGH_COVERAGE	ss5245695355	Oct 12, 2022 (156)
53	1000G_HIGH_COVERAGE	ss5245695356	Oct 12, 2022 (156)
54	1000G_HIGH_COVERAGE	ss5245695357	Oct 12, 2022 (156)
55	1000G_HIGH_COVERAGE	ss5245695358	Oct 12, 2022 (156)
56	1000G_HIGH_COVERAGE	ss5245695359	Oct 12, 2022 (156)
57	HUGCELL_USP	ss5446141028	Oct 12, 2022 (156)
58	HUGCELL_USP	ss5446141029	Oct 12, 2022 (156)
59	HUGCELL_USP	ss5446141030	Oct 12, 2022 (156)
60	HUGCELL_USP	ss5446141031	Oct 12, 2022 (156)
61	HUGCELL_USP	ss5446141032	Oct 12, 2022 (156)
62	TOMMO_GENOMICS	ss5676025668	Oct 12, 2022 (156)
63	TOMMO_GENOMICS	ss5676025669	Oct 12, 2022 (156)
64	TOMMO_GENOMICS	ss5676025670	Oct 12, 2022 (156)
65	TOMMO_GENOMICS	ss5676025671	Oct 12, 2022 (156)
66	TOMMO_GENOMICS	ss5676025672	Oct 12, 2022 (156)
67	TOMMO_GENOMICS	ss5676025673	Oct 12, 2022 (156)
68	EVA	ss5833220701	Oct 12, 2022 (156)
69	EVA	ss5833220702	Oct 12, 2022 (156)
70	EVA	ss5833220703	Oct 12, 2022 (156)
71	1000Genomes	NC_000001.10 - 212770762	Oct 11, 2018 (152)
72	gnomAD - Genomes Submission ignored due to conflicting rows: Row 38731262 (NC_000001.11:212597419::TATC 12811/138846) Row 38731263 (NC_000001.11:212597419::TATCTATC 17651/138816) Row 38731264 (NC_000001.11:212597419::TATCTATCTATC 15921/138836)...	-	Apr 25, 2021 (155)
73	gnomAD - Genomes Submission ignored due to conflicting rows: Row 38731262 (NC_000001.11:212597419::TATC 12811/138846) Row 38731263 (NC_000001.11:212597419::TATCTATC 17651/138816) Row 38731264 (NC_000001.11:212597419::TATCTATCTATC 15921/138836)...	-	Apr 25, 2021 (155)
74	gnomAD - Genomes Submission ignored due to conflicting rows: Row 38731262 (NC_000001.11:212597419::TATC 12811/138846) Row 38731263 (NC_000001.11:212597419::TATCTATC 17651/138816) Row 38731264 (NC_000001.11:212597419::TATCTATCTATC 15921/138836)...	-	Apr 25, 2021 (155)
75	gnomAD - Genomes Submission ignored due to conflicting rows: Row 38731262 (NC_000001.11:212597419::TATC 12811/138846) Row 38731263 (NC_000001.11:212597419::TATCTATC 17651/138816) Row 38731264 (NC_000001.11:212597419::TATCTATCTATC 15921/138836)...	-	Apr 25, 2021 (155)
76	gnomAD - Genomes Submission ignored due to conflicting rows: Row 38731262 (NC_000001.11:212597419::TATC 12811/138846) Row 38731263 (NC_000001.11:212597419::TATCTATC 17651/138816) Row 38731264 (NC_000001.11:212597419::TATCTATCTATC 15921/138836)...	-	Apr 25, 2021 (155)
77	gnomAD - Genomes Submission ignored due to conflicting rows: Row 38731262 (NC_000001.11:212597419::TATC 12811/138846) Row 38731263 (NC_000001.11:212597419::TATCTATC 17651/138816) Row 38731264 (NC_000001.11:212597419::TATCTATCTATC 15921/138836)...	-	Apr 25, 2021 (155)
78	gnomAD - Genomes Submission ignored due to conflicting rows: Row 38731262 (NC_000001.11:212597419::TATC 12811/138846) Row 38731263 (NC_000001.11:212597419::TATCTATC 17651/138816) Row 38731264 (NC_000001.11:212597419::TATCTATCTATC 15921/138836)...	-	Apr 25, 2021 (155)
79	gnomAD - Genomes Submission ignored due to conflicting rows: Row 38731262 (NC_000001.11:212597419::TATC 12811/138846) Row 38731263 (NC_000001.11:212597419::TATCTATC 17651/138816) Row 38731264 (NC_000001.11:212597419::TATCTATCTATC 15921/138836)...	-	Apr 25, 2021 (155)
80	gnomAD - Genomes Submission ignored due to conflicting rows: Row 38731262 (NC_000001.11:212597419::TATC 12811/138846) Row 38731263 (NC_000001.11:212597419::TATCTATC 17651/138816) Row 38731264 (NC_000001.11:212597419::TATCTATCTATC 15921/138836)...	-	Apr 25, 2021 (155)
81	Korean Genome Project Submission ignored due to conflicting rows: Row 2815390 (NC_000001.11:212597423::TATCTATCTATC 829/1832) Row 2815391 (NC_000001.11:212597419:TATC: 297/1832) Row 2815392 (NC_000001.11:212597423::TATCTATC 368/1832)...	-	Apr 25, 2020 (154)
82	Korean Genome Project Submission ignored due to conflicting rows: Row 2815390 (NC_000001.11:212597423::TATCTATCTATC 829/1832) Row 2815391 (NC_000001.11:212597419:TATC: 297/1832) Row 2815392 (NC_000001.11:212597423::TATCTATC 368/1832)...	-	Apr 25, 2020 (154)
83	Korean Genome Project Submission ignored due to conflicting rows: Row 2815390 (NC_000001.11:212597423::TATCTATCTATC 829/1832) Row 2815391 (NC_000001.11:212597419:TATC: 297/1832) Row 2815392 (NC_000001.11:212597423::TATCTATC 368/1832)...	-	Apr 25, 2020 (154)
84	Korean Genome Project Submission ignored due to conflicting rows: Row 2815390 (NC_000001.11:212597423::TATCTATCTATC 829/1832) Row 2815391 (NC_000001.11:212597419:TATC: 297/1832) Row 2815392 (NC_000001.11:212597423::TATCTATC 368/1832)...	-	Apr 25, 2020 (154)
85	Korean Genome Project Submission ignored due to conflicting rows: Row 2815390 (NC_000001.11:212597423::TATCTATCTATC 829/1832) Row 2815391 (NC_000001.11:212597419:TATC: 297/1832) Row 2815392 (NC_000001.11:212597423::TATCTATC 368/1832)...	-	Apr 25, 2020 (154)
86	Korean Genome Project Submission ignored due to conflicting rows: Row 2815390 (NC_000001.11:212597423::TATCTATCTATC 829/1832) Row 2815391 (NC_000001.11:212597419:TATC: 297/1832) Row 2815392 (NC_000001.11:212597423::TATCTATC 368/1832)...	-	Apr 25, 2020 (154)
87	8.3KJPN Submission ignored due to conflicting rows: Row 6270571 (NC_000001.10:212770761:TATC: 3463/16760) Row 6270572 (NC_000001.10:212770761::TATCTATCTATC 6887/16760) Row 6270573 (NC_000001.10:212770761::TATC 728/16760)...	-	Apr 25, 2021 (155)
88	8.3KJPN Submission ignored due to conflicting rows: Row 6270571 (NC_000001.10:212770761:TATC: 3463/16760) Row 6270572 (NC_000001.10:212770761::TATCTATCTATC 6887/16760) Row 6270573 (NC_000001.10:212770761::TATC 728/16760)...	-	Apr 25, 2021 (155)
89	8.3KJPN Submission ignored due to conflicting rows: Row 6270571 (NC_000001.10:212770761:TATC: 3463/16760) Row 6270572 (NC_000001.10:212770761::TATCTATCTATC 6887/16760) Row 6270573 (NC_000001.10:212770761::TATC 728/16760)...	-	Apr 25, 2021 (155)
90	8.3KJPN Submission ignored due to conflicting rows: Row 6270571 (NC_000001.10:212770761:TATC: 3463/16760) Row 6270572 (NC_000001.10:212770761::TATCTATCTATC 6887/16760) Row 6270573 (NC_000001.10:212770761::TATC 728/16760)...	-	Apr 25, 2021 (155)
91	8.3KJPN Submission ignored due to conflicting rows: Row 6270571 (NC_000001.10:212770761:TATC: 3463/16760) Row 6270572 (NC_000001.10:212770761::TATCTATCTATC 6887/16760) Row 6270573 (NC_000001.10:212770761::TATC 728/16760)...	-	Apr 25, 2021 (155)
92	8.3KJPN Submission ignored due to conflicting rows: Row 6270571 (NC_000001.10:212770761:TATC: 3463/16760) Row 6270572 (NC_000001.10:212770761::TATCTATCTATC 6887/16760) Row 6270573 (NC_000001.10:212770761::TATC 728/16760)...	-	Apr 25, 2021 (155)
93	14KJPN Submission ignored due to conflicting rows: Row 9862772 (NC_000001.11:212597419:TATC: 5800/28256) Row 9862773 (NC_000001.11:212597419::TATCTATCTATC 11644/28256) Row 9862774 (NC_000001.11:212597419::TATCTATCTATCTATC 3201/28256)...	-	Oct 12, 2022 (156)
94	14KJPN Submission ignored due to conflicting rows: Row 9862772 (NC_000001.11:212597419:TATC: 5800/28256) Row 9862773 (NC_000001.11:212597419::TATCTATCTATC 11644/28256) Row 9862774 (NC_000001.11:212597419::TATCTATCTATCTATC 3201/28256)...	-	Oct 12, 2022 (156)
95	14KJPN Submission ignored due to conflicting rows: Row 9862772 (NC_000001.11:212597419:TATC: 5800/28256) Row 9862773 (NC_000001.11:212597419::TATCTATCTATC 11644/28256) Row 9862774 (NC_000001.11:212597419::TATCTATCTATCTATC 3201/28256)...	-	Oct 12, 2022 (156)
96	14KJPN Submission ignored due to conflicting rows: Row 9862772 (NC_000001.11:212597419:TATC: 5800/28256) Row 9862773 (NC_000001.11:212597419::TATCTATCTATC 11644/28256) Row 9862774 (NC_000001.11:212597419::TATCTATCTATCTATC 3201/28256)...	-	Oct 12, 2022 (156)
97	14KJPN Submission ignored due to conflicting rows: Row 9862772 (NC_000001.11:212597419:TATC: 5800/28256) Row 9862773 (NC_000001.11:212597419::TATCTATCTATC 11644/28256) Row 9862774 (NC_000001.11:212597419::TATCTATCTATCTATC 3201/28256)...	-	Oct 12, 2022 (156)
98	14KJPN Submission ignored due to conflicting rows: Row 9862772 (NC_000001.11:212597419:TATC: 5800/28256) Row 9862773 (NC_000001.11:212597419::TATCTATCTATC 11644/28256) Row 9862774 (NC_000001.11:212597419::TATCTATCTATCTATC 3201/28256)...	-	Oct 12, 2022 (156)
99	A Vietnamese Genetic Variation Database Submission ignored due to conflicting rows: Row 641916 (NC_000001.10:212770761::TATC 2/14) Row 641917 (NC_000001.10:212770761:TATC: 39/51) Row 641918 (NC_000001.10:212770761::TATCTATCTATC 91/103)...	-	Jul 12, 2019 (153)
100	A Vietnamese Genetic Variation Database Submission ignored due to conflicting rows: Row 641916 (NC_000001.10:212770761::TATC 2/14) Row 641917 (NC_000001.10:212770761:TATC: 39/51) Row 641918 (NC_000001.10:212770761::TATCTATCTATC 91/103)...	-	Jul 12, 2019 (153)
101	A Vietnamese Genetic Variation Database Submission ignored due to conflicting rows: Row 641916 (NC_000001.10:212770761::TATC 2/14) Row 641917 (NC_000001.10:212770761:TATC: 39/51) Row 641918 (NC_000001.10:212770761::TATCTATCTATC 91/103)...	-	Jul 12, 2019 (153)
102	A Vietnamese Genetic Variation Database Submission ignored due to conflicting rows: Row 641916 (NC_000001.10:212770761::TATC 2/14) Row 641917 (NC_000001.10:212770761:TATC: 39/51) Row 641918 (NC_000001.10:212770761::TATCTATCTATC 91/103)...	-	Jul 12, 2019 (153)
103	A Vietnamese Genetic Variation Database Submission ignored due to conflicting rows: Row 641916 (NC_000001.10:212770761::TATC 2/14) Row 641917 (NC_000001.10:212770761:TATC: 39/51) Row 641918 (NC_000001.10:212770761::TATCTATCTATC 91/103)...	-	Jul 12, 2019 (153)
104	ALFA	NC_000001.11 - 212597420	Apr 25, 2021 (155)

History tab displays RefSNPs (Associated ID) from previous builds (Build) that now support the current RefSNP, and the dates, when the history was updated for each Associated ID (History Updated).

Associated ID	History Updated (Build)
rs139621404	Sep 17, 2011 (135)
rs60630635	May 25, 2008 (130)
rs144280275	Apr 25, 2013 (138)
rs386354577	Aug 21, 2014 (142)

Added to this RefSNP Cluster:

Submission IDs	Observation SPDI	Canonical SPDI	Source RSIDs
3325360746	NC_000001.11:212597419:TATCTATCTAT… NC_000001.11:212597419:TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC:TATCTATCTATCTATC	NC_000001.11:212597419:TATCTATCTAT… NC_000001.11:212597419:TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC:TATCTATCTATCTATC	(self)
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3325360746	NC_000001.11:212597419:TATCTATCTAT… NC_000001.11:212597419:TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC:TATCTATCTATCTATCTATC	NC_000001.11:212597419:TATCTATCTAT… NC_000001.11:212597419:TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC:TATCTATCTATCTATCTATC	(self)
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Publications tab displays PubMed articles citing the variation as a listing of PMID, Title, Author, Year, Journal, ordered by Year, descending.

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rs11404416