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GenBank: CR792457.15
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LOCUS CR792457 163282 bp DNA linear VRT 13-DEC-2012 DEFINITION Zebrafish DNA sequence from clone DKEY-228B2 in linkage group 21, complete sequence. ACCESSION CR792457 VERSION CR792457.15 KEYWORDS HTG. SOURCE Danio rerio (zebrafish) ORGANISM Danio rerio Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Actinopterygii; Neopterygii; Teleostei; Ostariophysi; Cypriniformes; Danionidae; Danioninae; Danio. REFERENCE 1 (bases 1 to 163282) AUTHORS Dunn,M. CONSRTM Genome Reference Consortium TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (13-DEC-2012) Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Cambridgeshire, CB10 1SA, UK. E-mail enquiries: grc-help@sanger.ac.uk Clone requests: http://www.sanger.ac.uk/Projects/D_rerio/faqs.shtml#dataeight COMMENT On Dec 5, 2006 this sequence version replaced CR792457.14. -------------- Genome Center Center: Wellcome Trust Sanger Institute Center code: SC Web site: http://www.sanger.ac.uk Contact: grc-help@sanger.ac.uk -------------- This sequence was finished as follows unless otherwise noted: all regions were either double-stranded or sequenced with an alternate chemistry or covered by high quality data (i.e., phred quality >= 30); an attempt was made to resolve all sequencing problems, such as compressions and repeats; all regions were covered by at least one subclone; and the assembly was confirmed by restriction digest, except on the rare occasion of the clone being a YAC. Clone-derived Zebrafish pUC subclones occasionally display inconsistency over the length of mononucleotide A/T runs and conserved TA repeats. Where this is found the longest good quality representation will be submitted. Any regions longer than 1kb tagged as misc-feature 'unsure' are part of a tandem repeat of more than 10kb in length where it has not been possible to anchor the base differences between repeat copies. The region has been built up based on the repeat element to match the total size of repeat indicated by restriction digest, but repeat copies may not be in the correct order and the usual finishing criteria may not apply. DKEY-228B2 is from a Zebrafish BAC library VECTOR: pIndigoBAC-5. FEATURES Location/Qualifiers source 1..163282 /organism="Danio rerio" /mol_type="genomic DNA" /db_xref="taxon:7955" /chromosome="21" /clone="DKEY-228B2" /clone_lib="DanioKey" ORIGIN 1 aagcttagtc acttccctta tttgttgcat atgcatccac agttgaagag aaacatccac 61 ggaagacgag aggaagagag agaagatgag gtgaactgtt caactttaat tccagccgaa 121 gagtgagtga aagaggcgag tatttatgtt ctgtggtgat tgcgggtgca ggtgcaggta 181 attagtattc tggtgattgt tcacgggtgt ggtgagtggt ggatggtgag ggagaccggt 241 gattggagca acaggaatga gccaagggtg tgacaatacg agcttattgt cacatagagc 301 tgcggtcaca ctgcactttt ctcctcatag acttccattc gtacgcacgt gaatgcgtca 361 gaccggaaac gcaagttcat gcgtcaagtc ttgcagttca ctgcgatgca aagttcaagc 421 ttagtgaact ctgacctgct aaatcgcatc acatgattgc acgagaccaa tcgagtatca 481 aaacatgacc tctctgaaca gaaattcaca atatggagca atcactcgct ttttttaaaa 541 tgtttaatca tcttgtttaa tcccatcccc tttcgcagcg ccgtatgaca gaattttgca 601 ggcataaact ctagtgtgac cgcagcttta gattgttatg ataacatgat atcattgcct 661 tcagtgattt cctgaagata aatacctaaa aataacgcaa ctggaataac tgcagcagtc 721 gtaatcgtcg atttcatatg aagcaagagc tcacaatgac atatgatgac gtgtgcaggt 781 gctgtagtgg tgtcccattt tttaggggta cattttgaag cccttacctt tcacactctg 841 tttgaagggc caaaggaaag gggtggggta caaaaataga attgggattg ggccttaatg 901 tacacactgg gaagcattta atagaattaa attaggcttc ttgagcaaca aaaacagttc 961 aagttttgat aaactctact tttgcttttt attaataata agtctattat atatttattt 1021 atttattttc ttctgcttat ttctttcttt aacagggatt gccacagtga aatgaaccag 1081 aaattattgc ataactcatt taaatagtaa taaatatgat aatagttagt tctacaatta 1141 taaacataga tacggaatgt ccagcaggag ctatccagat cacacaaagc agcctgaccc 1201 tgaccccttg atgacagcaa tgcatataaa agtacagtat gtacaaacat caaatccaac 1261 ccagatgtgt aatgatgtct gaggccttgg caatggcatg aatactggca gcgtgctata 1321 ctaatgatta atggtggcca ggtggggtct tagtggcact atggcgttac gtctgcctgt 1381 ttactcaccc gacctcatcc tctccagccc gtcattcatt aaatttacag ccgagccggt 1441 atgctaatga gatttatcca caggcggaaa ctcccacatg gttcatcttt agttttaatc 1501 cgcctgacaa gcgtcattcc atcagcatgc gagtcccacc cattggcgtt 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