Conserved Protein Domain Family
FadE_coli

?
NF038187: FadE_coli 
acyl-CoA dehydrogenase FadE
This HMM describes a narrow clade of medium-chain and long-chain acyl-CoA dehydrogenases that includes YafH from Escherichia coli K-12 and Salmonella enterica LT2 (also called FadF), now called FadE.
Statistics
?
PSSM-Id: 439499
Aligned: 29 rows
Threshold Bit Score: 1648.59
Created: 11-Oct-2024
Updated: 3-Dec-2024
Structure
?
Aligned Rows:
Sequence Alignment
?
Format: Row Display: Color Bits: Type Selection:
WP_178887764          3 ILSILATVVLLGALFYHRVSLFISSLIVLAWTAALGVAGLWSAWVLVPLAIILVPFNFAPMRKSMISAPVFRGFRKVMPP 82  Escheric...
9_ncbifamImport       1 LLWTLAMLFVLGALTYLRVSLLTSSFIAAIVLTIGTAAEAVSPLTWIIFLVIALPLNISSFRKNFLTKPMLKMYRGIMPE 80 
18_ncbifamImport      1 LLWILAFLFVLGALAYLRVSLLTSSIIAAVVMAIGTATEVVSPLSWIIFLIVALPLNVSAFRKNFLTKPILKIYRGIMPE 80 
8_ncbifamImport       1 LLWILAMIFTIGAFAYLRVALLTATLGTAIVLAIGTGAASLSPLLWVVFLAIALPLNVSSFRQNVISRSLLKMYRGIMPE 80 
5_ncbifamImport       1 LLWIIAMILVLGALAYLRVSLLTATIAAAVVMTAGWTLDVVGPISWIVFLVIALPLNISAFRQNVISRPLMKIYRGIMPE 80 
23_ncbifamImport      1 LLWIIAMILVLGAMAYLRVSLLTATLGALVVMAVGSATEIVNTTAWIVFLVVALPFNIKSFRQQFISRPLMKVYRGIMPE 80 
25_ncbifamImport      1 LLWIIAMIFVLGAMAYLRVSLLSTTIAAAIVLVVGSTLDIIGVITWIVFLVIALPLNIKSFRQNFISRPLIKVYRGIMPE 80 
27_ncbifamImport      1 LLWSIALLVVLGACAYLRVSLLTATAAAAIMLTAGWTLDVVGLWGGIIFLIIALPLNISSIRQSLITRPLLKVYRGIMPE 80 
21_ncbifamImport      1 IIWLIVALTLTWFMSYTRASLSSFTLCFAALMALGSLFNIIGIVSWLLFAVIALPINIDNIRQQFISMPLLAIFKKIMPQ 80 
REF_eggd:MADE_02152   4 FIWFLLVVLTLAVASYQRTSLVTAVAIGAGVMILGTLFGDIGLLGWVVFLALTLPFTLANIRQQYISKKLLAFYRKVMPE 83 
WP_178887764         83 MSRTEKEAIDAGTTWWEGDLFQGKPDWKKLHNYPQPRLTAEEQAFLDGPVEEACRMANDFQITHELADLPPELWAYLKEH 162 Escheric...
9_ncbifamImport      81 MSSTEKEAIEAGTTWWDADIFAGKPDWQKLHNYPAARLTAEEQAFLDGPVEEVCKMLNQHQVSHELGDLPQEIWQYLKDH 160
18_ncbifamImport     81 MSSTEKEAIEAGTTWWEADLFAGNPDWKKLHNYPVARMSADEQAFLDGPVEEVCKMLNQHQVSHQLGDLPPEIWQYLKDN 160
8_ncbifamImport      81 MSSTEKEAIEAGTTWWEADLFAGKPDWSKLHNYPKASLTAEEQAFLDGPVEEVCRMVNQHQVSHELADLPDEVWQYLKDH 160
5_ncbifamImport      81 MSSTEKEAIEAGTTWWEADLFSGNPNWKKLHNYPVARLSADEQAFLDGPVEEVCRMVNQHQVSHQLADLPAEVWQYLKDH 160
23_ncbifamImport     81 MSSTEKEAIEAGTTWWEADLFAGNPNWSKLHNYPQARLTADEQAFLDGPVETVCAMLNQHQVSHQLADLPQDVWQYLKDN 160
25_ncbifamImport     81 MSSTEKEAIEAGTTWWEADLFAGNPNWSKLHNYPKARLTADEQAFIDGPVEEVCKMLNQHEVSHVLGDLPQDVWQFLKDH 160
27_ncbifamImport     81 MSSTEKEAIDAGTTWWEADLFAGNPNWKKLHNYPTARLSAEEQAFIDGPVNEVCRMVNEHQVSHQFADLPADVWQYLKDN 160
21_ncbifamImport     81 MSSTEQEAIDAGTTWFDADLFRGDPDWLKLHNYPRPRLSSQEKAFLDGPVEQVCAMVNDWHITHEIADLPPEIWQFLKEN 160
REF_eggd:MADE_02152  84 MSSTEQEAIDAGTVWWDGDIFSGKPDWDKLHRIPKGRLTAEEQAFLDGPCDKVCSMVDEWQINHKDADLPPEIWQFLKEH 163
WP_178887764        163 RFFAMIIKKEYGGLEFSAYAQSRVLQKLSGVSGILAITVGVPNSLGPGELLQHYGTDEQKDHYLPRLARGQEIPCFALTS 242 Escheric...
9_ncbifamImport     161 GFFAMIIKKKYGGLEYSAYAQSRVLQKLAGVSSELASTVGVPNSLGPGELLQHYGTPAQQDHYLPRLAKGLEVPCFALTS 240
18_ncbifamImport    161 GFFAMIIKKKYGGLEYSAYAQSRVLQKLAGLSSELASTVGVPNSLGPGELLQHYGTTEQQDHYLPRLAQGLEVPCFALTS 240
8_ncbifamImport     161 GFFAMIIKKKYGGLEYSAYAQSRVLQKLAGLSSELASTVGVPNSLGPGELLQHYGTPAQQDHYLPRLAKGLEVPCFALTS 240
5_ncbifamImport     161 GFFAMIIKKKYGGLEYSAYAQSRVLQKLAGVSSELASTVGVPNSLGPGELLQHYGTPEQQNHYLPRLAKGLEVPCFALTS 240
23_ncbifamImport    161 GFFAMIIKKKYGGLEYSAYAQSRVLQKLAGVSSELASTVGVPNSLGPGELLQHYGTTEQQDHYLPRLAKGLEVPCFALTS 240
25_ncbifamImport    161 GFFAMIIKKKYGGLEYSAYAQSCVLQKLAGVSSELASTVGVPNSLGPGELLQHYGTKEQQDHYLPRLAQGLEVPCFALTS 240
27_ncbifamImport    161 GFFAMIIKKKYGGLEFSAYAQSRVLQKLAGVSSELASTVGVPNSLGPGELLQHYGTAEQQDHYLPRLAKGLEVPCFALTS 240
21_ncbifamImport    161 KFFAMIIKKQYGGLEFSAYAQSRVLQKLTGVSSVLASTVGVPNSLGPGELLQEYGTKEQQDYYLPRLAKGEEIPCFALTS 240
REF_eggd:MADE_02152 164 KFFAMIIKKEYGGLAFSAYAQSRVLQKLAGVSAVLSSTVGVPNSLGPGELLQHYGTKEQQDHYLPRLAAGEEIPCFALTG 243
WP_178887764        243 PEAGSDAGAIPDTGIVCMGEWQGQQVLGMRLTWNKRYITLAPIATVLGLAFKLSDPEKLLGGAEDLGITCALIPTTTPGV 322 Escheric...
9_ncbifamImport     241 PEAGSDAGAIPDFGIVCKGQWEGEEVLGMKLTWNKRYITLAPVATVLGLAFKLQDPDKLLGDKEELGITCALIPTDIDGV 320
18_ncbifamImport    241 PEAGSDAGSIPDFGIVCKGQWEGEEILGMKLTWNKRYITLAPVATVLGLAFKLRDPDQLLGDKAELGITCALIPTDMEGV 320
8_ncbifamImport     241 PEAGSDAGAIPDYGVVCKGEWEGEEVLGMKLTWNKRYITLAPTATVLGLAFKLRDPDQLLGNQEELGITCALIPTDIEGV 320
5_ncbifamImport     241 PEAGSDAGSIPDFGIVCKGQWEGEEVLGMKLTWNKRYITLAPVATVLGLAFKLRDPDHLLGDKEELGITCALIPTDVEGV 320
23_ncbifamImport    241 PEAGSDAGAIPDFGIVCKGEWEGEEVLGMKLTWNKRYITLAPVATVLGLAFKLRDPDHLLGETEELGITCALIPTDVEGV 320
25_ncbifamImport    241 PEAGSDAGSIPDFGVVCKGEFQGEEVLGMKLTWNKRYITLAPVATVLGLAFKLRDPDHLLGDKEELGITCALIPTDIPGV 320
27_ncbifamImport    241 PEAGSDAGSIPDYGVVCKGMWKGEEVLGMKLTWNKRYITLAPIATVLGLAFKLRDPERLLGGEEELGITCALIPTDVEGV 320
21_ncbifamImport    241 PEAGSDAGSIPDYGVICHGQFNGEDVLGMKLTWDKRYITLAPIATVLGLAFKLQDPDNLLSEQEDLGITCALIPTDIEGI 320
REF_eggd:MADE_02152 244 PEAGSDAGAIPDVGVVCKGEWNGEEVLGMRLTFNKRYITLAPVATVIGLAFKLQDPEGLLGDNKEPGITCALIPRDTKGL 323
WP_178887764        323 EIGRRHFPLNVPFQNGPTRGKDVFVPIDYIIGGPKMAGQGWRMLVECLSVGRGITLPSNSTGGVKSVALATGAYAHIRRQ 402 Escheric...
9_ncbifamImport     321 ETGRRHFPLNCMFQNGPTRGNEVFVPLSFIIGGPEMAGQGWRMLVECLSVGRGITLPSNSAGGIKTAAVATGAYARIRRQ 400
18_ncbifamImport    321 ETGRRHFPLNCMFQNGPTRGNEVFVPLSFIIGGPEMAGQGWRMLVECLSVGRGITLPSNSAGGIKIAAVATGAYARIRRQ 400
8_ncbifamImport     321 ETGRRHFPLNCMFQNGPTRGTDVFVPLSFIIGGVEMAGQGWRMLVECLSVGRGITLPSNSAGGIKTAAVATGAYARIRRQ 400
5_ncbifamImport     321 ETGRRHFPLNCMFQNGPTRGNEVFVPLSFIIGGPKMAGQGWRMLVECLSVGRGITLPSNSAGGVKTAALATGAYARIRRQ 400
23_ncbifamImport    321 ITGRRHFPLNCMFQNGPTQGNEVFVPLSFIIGGPKMAGQGWRMLVECLSVGRGITLPSNSAGGIKTAALATGAYARIRRQ 400
25_ncbifamImport    321 ETGRRHFPLNCMFQNGPTRGNEVFVPLSFIIGGPEMAGQGWRMLVECLSVGRGITLPSNSAGGVKTAAVATGAYARIRRQ 400
27_ncbifamImport    321 ETGRRHFPLNCMFQNGPTRGKDVFVPLSFIIGGPKMAGQGWRMLVECLSVGRGITLPSNSAGGVKTAALATGAYARIRRQ 400
21_ncbifamImport    321 TIGRRHFPLNVPFQNGPTQGKDVFVPLDFIIGGSDMAGQGWRMLVECLSVGRAITLPSNSTGGVKTAALATGAYSRIRRQ 400
REF_eggd:MADE_02152 324 EIGRRHLPLNTPFQNGPIKGEDIFVPIDYIIGGPQMAGRGWRMLVECLSVGRCITLPSSAAGGAKSVSLATGAYARIRRQ 403
WP_178887764        403 FKISIGKMEGIEEPLARIAGNAYVMDAAASLITYGIMLGEKPAVLSAIVKYHCTHRGQQSIIDAMDITGGKGIMLGQSNF 482 Escheric...
9_ncbifamImport     401 FKLPIGKLEGIEEPMARIGGNAYLMEAVTSLTTTGIDLGEKPSVISAIVKFHLTDRMQKCVIDAMDIHGGKGVCLGPNNY 480
18_ncbifamImport    401 FKLPIGKLEGIEEPMARIGGNAYLMDAVTSLTTTGIDLGEKPSVISAIVKFHLTDRMQKCVIDAMDIHGGKGVCLGPNNY 480
8_ncbifamImport     401 FKLPIGKLEGIEEPMARIGGNAYLMDAVTTLTTTAIDLGEKPSVISAIVKYHLTDRMQRCVIDAMDIHGGKGVCLGPNNY 480
5_ncbifamImport     401 FKLPIGKLEGIEEPMARIGGNAYLMDAVTSLTTTGIDLGEKPSVISAIVKYHLTDRMQKCIIDAMDIHGGKGVCLGPNNY 480
23_ncbifamImport    401 FKLPIGKLEGIEEPMARIGGNAYLMDAVTSLTTTGIDLGEKPSVISAIVKFHLTDRMQKCVIDAMDIHGGKGVCLGPNNY 480
25_ncbifamImport    401 FKLPIGKLEGIEEPMARLGGNAYLMDAVATLTTTAIDLGEKPSVVSAIVKFHLTDRMQKCVIDAMDIHGGKGVCLGPNNY 480
27_ncbifamImport    401 FKLPIGKLEGIEEPMARIGGNAYLMDAVTSLTTTGIDLGEKPSVISAIVKYHLTDRMQKCVIDAMDIHGGKGVCLGPNNY 480
21_ncbifamImport    401 FKMPIGKMEGIEEPLARIGANAYLMDAVTTMSTGAIDLGEKPSVISAIAKYHLTEKMRSSIIDAMDIHGGKGICMGPNNY 480
REF_eggd:MADE_02152 404 FRMPVGHMEGVEEMLARIGGNAYLMDGVTRFSTVGVDLGEKPSVISAICKYHLTEKMRQVINDAMDVHGGKGVMLGPNNY 483
WP_178887764        483 LARAYQGAPIAITVEGANILTRSMMIFGQGAIRCHPYVLEEMEAAKNND----VNAFDKLLFKHIGHVGSNKVRSFWLGL 558 Escheric...
9_ncbifamImport     481 LGRGYQAAPIAITVEGANILTRSMIIYGQGAIRCHPYVLAEMESAFDTDaekgLNDFDAAIFGHIGFTASNLVRSFWLGL 560
18_ncbifamImport    481 LGRGYQAAPIAITVEGANILTRSMIIYGQGAIRCHPYVITEMESAFDTDanrgLDTFDAAIFGHIGFAISNLVRSFWLGV 560
8_ncbifamImport     481 LGRGYQAAPIAITVEGANILTRSMIIYGQGAIRCHPYVLAEMESAFDPDankgLRDFDAAIFGHIGFTTSNLVRSLWMGL 560
5_ncbifamImport     481 LGRGYQAAPIAITVEGANILTRSMIIYGQGAIRCHPYVLAEMESAFDTQsgqgLANFDAAIFGHIGFATSNFVRSFWLGL 560
23_ncbifamImport    481 LGRGYQAAPIAITVEGANILTRAMIIYGQGAIRCHPYVLTEMESAFDTEsgqgLANFDAAIFGHIGFAISNFIRSFWMGL 560
25_ncbifamImport    481 LGRGYQAAPIAITVEGANILTRSMIIYGQGAIRCHPYVLAEMESAFDTDanrgLANFDAAIFGHIGFATSNFIRSFWMGL 560
27_ncbifamImport    481 LGRGYQAAPIAITVEGANILTRSMIIYGQGAIRCHPYVLAEMDSAFDKDvrqgLNKFDAALFGHIGFTISNLIRSVWMGL 560
21_ncbifamImport    481 LARGYQGAPIAVTVEGANILTRSMIIYGQGAIRCHPYVLAELEAANNSDneqaLNDFDHALFGHIGFSLSNISRSLWCSI 560
REF_eggd:MADE_02152 484 LGRGYQGVPVSITVEGANILTRNMMIFGQGAMRCHPYVLKEIEAASIEDkkeaLQAFDKAVFGHIGFAVANTVRSIWFSL 563
WP_178887764        559 TRGLTSSTPTGDATKRYYQHLNRLSANLALLSDVSMAVLGGSLKRRERISARLGDILSQLYLASAVLKRYDDEGRNEADL 638 Escheric...
9_ncbifamImport     561 TSSRFSNAPYSDKTKRYYQHMNRFSANLALLSDLAMATLGGDLKRKERISARLGDLLSQLYLSSATLKRYQDEGRQTEDL 640
18_ncbifamImport    561 TSSRFSNAPYSDKTKRYYQQMNRFSANLALLSDMAMATLGGELKRKERISARLGDLLSQLYLTSATLKRYQDEGRQTEDL 640
8_ncbifamImport     561 TSSYFSNAPYADKTKRYYQQMNRFSANLALLSDLAMATLGGNLKRKERISARLGDLLSQLYLASATLKRYEDEGRLTEDL 640
5_ncbifamImport     561 TSSRFSNAPYSDKTKRYYQHMNRFSANLALLSDLAMATLGGNLKRKERISARLGDLLSQLYLASATLKRYEDEGRQTDDL 640
23_ncbifamImport    561 TSSRFTNSPYSDKTKRYYQQMNRFSANLALLSDLAMATLGGNLKRKERISARLGDLLSQLYLASATLKRYQDEGRLVEDL 640
25_ncbifamImport    561 TSSRFSNSPYSDKTKRYYQQMNRFSANLALLSDLAMATLGGNLKRKERISARLGDLLSQLYLTSATLKRYEDDGRLTEDL 640
27_ncbifamImport    561 TGSRFSNAPYGDKTKRYYQHMNRFSANLALLSDLAMATLGGNLKRKERISARLGDMLSQLYLASATLKRYQDEGRQTEDL 640
21_ncbifamImport    561 TGSRFLGSPYDDGTRRYYQLLTRFSANLAMLSDISMLSLGADLKRKERISARLGDVLSQLYLASATLKRYNDEGRNTADL 640
REF_eggd:MADE_02152 564 TNGAFSSAPFTDETARYYKLLQGYSANLALLTDVSMGVLGGDLKRRERLSARLGDILSGLYMGSTTLKRFDEEGRLKEDL 643
WP_178887764        639 PLVHWGVQDALYQAEQAMDDLLQNFPNRVVAGLLNVVIFPTGRHYLAPSDKLDHKVAKILQVPNATRSRIGRGQYLTPSE 718 Escheric...
9_ncbifamImport     641 ALVQWAVEDSLYKLQDSLDDLLDNFPMGL-GRVLRVIMFPFGRPLKRPSDILDHKVAKIMQTPCASRDRLAKGQFLTACE 719
18_ncbifamImport    641 PLVQWAVEDSLYKLQDSLDDLLNNFPMGL-GFVLRGIIFPFGRPLKRPSDVLDHKVATIMQTPCASRDRLGKGQFWTPCE 719
8_ncbifamImport     641 PLVQWAVEDALYKLQSSLDDLLDNFPMGL-GIALRVIIFPFGRPLKRPSDVLDHKVAKIMQTPCASRERLGKGQFWTPSE 719
5_ncbifamImport     641 PLVQWAVEDALYKLQASLDDLLDNFPMGL-GGVLRVVMFPFGRPLKRPSDVLDHKVAKIMQTPCESRDRLGKGQFWTNSE 719
23_ncbifamImport    641 PLVQWAVEDSLHKLQTALDELLDNFPMGL-GPVLRVVIFPFGRPLKRPSDVLDHKVAQIMQTPCASRERLGQGQYWTASQ 719
25_ncbifamImport    641 PLVQWAVEDSLYKLQDSLDDLLNNFPMGL-GIALRAVIFPFGRPIKRPSDVLDHKVAKIMQTPCASRDRLGKGQFWTASE 719
27_ncbifamImport    641 PLVQWAVEDALFKLQASLDELLDNFPAGL-GGVLRVLLLPFGRPLKRPSDVLDHKVAKIMQTPCASRERLGQGQFWEACD 719
21_ncbifamImport    641 PLVQWAVEDCLYNIQHAIDELISNFPNKIVGKLLRVIIFPLGTWLKKPNDETSHKVAQLLQTPGSARTRLGQGQYLTRDG 720
REF_eggd:MADE_02152 644 PLLHWAMQTTLHDIETAIDDFLANFPNRAIAAALRVMVIPFGRRIGKPSDKTEHAIAKMLQTPSTARSRLGYGQYLTREE 723
WP_178887764        719 HNPVGLLEEALVDVIAADPIHQRICKELGKNLPFTRLDELAHNALVKGLIDKDEAAILVKAEESRLRSINVDDFDPEELA 798 Escheric...
9_ncbifamImport     720 NNPVGIQEQTFKDIIACEPLHDKVCKAAGKRLPFIWLDKVAAEGKALGILSEDEISLLERTEIGRMKSINVDDFDPDELK 799
18_ncbifamImport    720 NNPVGVQEQTFKDILACEPLHAKVSKAAGKRIPFMWLDKIAAQGKALGVLTDEEVALLERAEIGRMKSINVDDFDPDELK 799
8_ncbifamImport     720 HNAVGIQEQTFKDIIASEPIYDKVCKAAGKRLPFMWLDKIAAEGKALGVLSEEEVALLERAEIGRMKSINVDDFDHEELK 799
5_ncbifamImport     720 HNAVGIQEQTLKDILAAEPLFDKVCKASGKRLPFMWLDKVAAEGKALGVLSDSEIQLLERAEIGRMKSINVDDFDPAELR 799
23_ncbifamImport    720 YNPVGIQEQTFKDILAAEPLYDKVCKASGKRLPFMWLDKVAAEGRALGVLSDSEIALLERAEIGRMKSVNVDDFAPEELQ 799
25_ncbifamImport    720 FNAVGIQEQTFKDILAAEPLYDKVCKAAGKRLPFMWLDKVAAEGKALGVLSDSEIALLERAEIGRLKSINVDDFDTDELR 799
27_ncbifamImport    720 NNPVGVQEQTFKDILAAEPLYDKVCKAAGKRLPFMWLDQVAAEGKALGILSDAEIALLEKAEIGRMKSINVDDFDPAELV 799
21_ncbifamImport    721 NNIFGRLEQVLEDIISCEPIYEKVCRELNKKLPFYHLDKVAELGLTNNIISKVEAELLTTAEVGRQWVIAVDDFDSKDMT 800
REF_eggd:MADE_02152 724 GSLFGDLEQTLDDVLASEPIFERICKHKKAKLPFTRLDTLADEALAEEVINEEEANLLRKTEAGRLRTINVDDFDHEELV 803
WP_178887764        799 TKPVKLPEK-VRKVEAA 814 Escherichia coli
9_ncbifamImport     800 AM--VVAK--TKHEQAA 812
18_ncbifamImport    800 AM--AIGK--QSHEQAA 812
8_ncbifamImport     800 AR--TLEY--TKEVQAA 812
5_ncbifamImport     800 PE--VVSA--TSQERAA 812
23_ncbifamImport    800 AQ--VVKA--AKQVKAA 812
25_ncbifamImport    800 AQ--LAPK--AKQEKAA 812
27_ncbifamImport    800 AQ--TTTG--KSQEQAA 812
21_ncbifamImport    801 A-----------FSGSA 806
REF_eggd:MADE_02152 804 AKVNSTSATkKRGGKAA 820
| Disclaimer | Privacy statement | Accessibility |
NCBI Home NCBI Search NCBI SiteMap