Conserved Protein Domain Family
PLN03120

?
PLN03120: PLN03120 
nucleic acid binding protein; Provisional
Statistics
?
PSSM-Id: 215588
Aligned: 43 rows
Threshold Bit Score: 311.592
Created: 9-Dec-2010
Updated: 25-Oct-2021
Structure
?
Aligned Rows:
Sequence Alignment
?
Format: Row Display: Color Bits: Type Selection:
115455345   6 RAVRTVRVRNISDLAGEREVREFFSFSGEIEHVDIRCDGvATGRTAYVTFKDPKALEIALLLSGATIVDRVVNITPAEDY 85 
168043598   1 --IHTVRVSNVSSKATEHDIQDFFSFSGEIEHIKLLKDG-ELSQIAFVTFKEAQALETALLLSGATVVDQAVTIAPADES 77 
168031266   4 DEIHTVRVSNVSPKATEHDIQDFFSFSGEIQYIKLIKDG-ALSQTAFVTFTDAQALETALLLSGATVVDQAVTITPADES 82 
168001561   1 ---NTVRVTNVSVKATAHDIHDFFSFSGEIENIELHRDG-D-TQIALVTFKEAQALDTALLLSGATVVDRAVNITPLEDE 75 
168005195   2 AGVHTVRVSNVSLKANEHDIQDFFSFSGEIEHIRLLSDG-ELSQIAFVTFKEAQALETALLLSGATVVDKAVTIAPADES 80 
255569508   3 QQTRTVQVKHLSDLASEREIHEFFSFSGEIEHIDIVREN-GESRTAFVTFKDPKALEIALLLSGATIVDKIVSITPVENY 81 
224146020   6 MQTRTVEVRNVSDLASEREVHEFFSFSGEIEHIHIQREN-GQSKTAFVTFKDPKALEIALLLSGATLVDRIVTITPAENY 84 
224123716   1 MQTRTVEVKNVSDLASEREVHEFFSFSGEIENIHIQRDH-GQSKTAFVTFKDPKALEIALLLSGATIVDQIVAITPVENY 79 
225439270   1 MQTRTVQVGHVSDLAGEREIHEFFSFSGDIEHVEILRDS-GQLRTAFVTFKDPKALEIALLLSGATIVDQVVTITPVENY 79 
297801014   2 QTTRSVQVNNVSDLATEREIHEFFSFSGDIEHIEIQKEV-GQSRIAFVTFTDPKALEIALLLSGATIVDQIVTITRAENH 80 
115455345  86 iyipvtdqqlvvsevvGEVTSTAPNADLdqp-teaNASPTTGRVYVSKAHDVMTTVIARGSAMRQDAVNKAKAFDEKHQL 164
168043598  78 ----------------EKLARDVEQVSLda---ttAEPTVSPLKFPSSAQEIFQNMLAKGYVLGNNTMSKAKAFDEKHQL 138
168031266  83 ----------------EKLANSVEDVPL-------DANTAEPTPAKKSAEEFIKNILAKGSTLGNNTVSKAKAFDEKHQL 139
168001561  76 ----------------LSPSINSIPRDKafg--ndGGFAGPSSHTPNQAVDVISTMLAKGFILGKDAVSKAKEFDAKHDL 137
168005195  81 ----------------ERLATSVDNVSLdststdkPSDASAPKPVTKSAQEAFQSMLEKGYILGNNTMSKAKAFDEKHQL 144
255569508  82 -----------------VPKRELQAKTS---------PPNNGRMYVNRAQEVVSTMLAKGSALGQDAMNKAKAFDEKHQL 135
224146020  85 vlnrelqevrnvenavSVVPSENFPSNVeg----kTSPSGSGRVYVSRAQEVVTSVLAKGSAISQDAMNKAKAFDEKHRL 160
224123716  80 vpnrelqevrnmdiaiHVVPSEDFPSNVeg----kTSPSGSGRVYVSRAQEVVTSMLAKGSAIGQDAMNKAKAFDEKHRL 155
225439270  80 vptaerevsitddavcQVPDGDVSPNAEqg----kATSPNNGRVYVNKAQDVVTSMLAKGSAIGQDAMNKAKAFDEKHQL 155
297801014  81 vqrre-------mqevRMVDNAMPLGLPesttqtkTTVDGNSRAYVSKAQDVVATVLAKGSALGQDAVNKAKAFDEKHQL 153
115455345 165 R-----------------------------ANASAKINSFDKRVGISEKINSGITVVNEKVKSVDQRLHVSDKTMAALLA 215
168043598 139 Sanas----------------------qiaANARANVVSIDNKIGITQKLSAGTAAINQQVKAVDEKYHFAEKTRAAVQA 196
168031266 140 Tanat----------------------qlaANAKANVVKIDDKIGITKKLSAGTAAINQQVKVVDEKYQVAEKTRAAVQA 197
168001561 138 S-----------------------------ASAKSSVVNFDKNIGISEKLSTGTAVVNKQMKAVDEKYQVSQKTRAALAV 188
168005195 145 TanasqlaenakanasqlaenakanasqlaANAKANVVNIDNKIGISQKLSAGTAAINQQVKAVDEKYHVSEKTRTALQA 224
255569508 136 T-----------------------------ASASAKVFSLDRKVGLTEKLTVGISVVNEKVKSVDQRLHVSDKTMAAIFA 186
224146020 161 S-----------------------------ASASEKVTSFDRRVGLTEKLTIGISVVNEKVKSVDQRLHVSDKTMAAIFA 211
224123716 156 S-----------------------------ANASEKVISFDRRVGLTEKLTVGISVVNEKVKSVDQRLHVSDKTMAAIFA 206
225439270 156 T-----------------------------ASASAKVISFDRRVGLTEKLTVGISVVNEKVKSVDQRLHVSDKTMAALLA 206
297801014 154 R-----------------------------ANASAKVSSFDKRVGLTEKLTVGISAVNEKVKSVDQKLQVSDKTMAAIFA 204
115455345 216 AERKLNDTGSAVKTNRYVSAGTSWLNGAFSKVAKAGHVAGSRTREKFQI----------AVSNLTAKGPAVVA 278
168043598 197 TEQKLNAAGSAIAKNKYVLTGTTWVVGAYAKVAKAAEEVGQKTLEKVS------------------------- 244
168031266 198 TEQKLNAAGSAIAKNRYVLTGTSWVVGAYAKVAKAAEEVSNKTLEKVAT----------------LGAGEHKS 254
168001561 189 AEENVKTAGSALMKNRYILTGASWVTGAFSRVQKVAAEVSQKTIEKAHT--------------METDHNSGRV 247
168005195 225 TEQKLNAAGSAIAKNKYILTGTTWVVGAYAKVAKTAEEVGQKTLERVATlsgdqkgassPSNASEGFGPPPPY 297
255569508 187 AERKINDTGSAVKSSRYVTAGAAWLNGAFDKVARAGQAAGTKTREKFNM----------AVSNLTAKESPIAV 249
224146020 212 AERKLNDTGSAVKSSRYVSAGTAWLNGAFSKVARAGQVAGTKTREKFNL----------AVSNLTAKESPIAV 274
224123716 207 AERKINDTGSAVKSSRYVSAGTAWLNGAFSKVAKAGQVAGTKTRAKFNS----------AVSNLTAKESPIAV 269
225439270 207 AERKLNNTGSAVKTSRYVTAGTTWLNGAFTKVAKAGQIAGTKTREKFHL----------AVSNLTAKDPSIVV 269
297801014 205 AEKKLNDTGSAVKSSRYVTAGAAWFSGAFSKVARVGQVAGSKTKEKFNL----------AVSNMSSKDTPIAV 267
| Disclaimer | Privacy statement | Accessibility |
NCBI Home NCBI Search NCBI SiteMap