Conserved Protein Domain Family
FadE_coli

?
NF038187: FadE_coli 
acyl-CoA dehydrogenase FadE
This HMM describes a narrow clade of medium-chain and long-chain acyl-CoA dehydrogenases that includes YafH from Escherichia coli K-12 and Salmonella enterica LT2 (also called FadF), now called FadE.
Statistics
?
PSSM-Id: 439499
Aligned: 29 rows
Threshold Bit Score: 1648.59
Created: 24-Apr-2023
Updated: 3-May-2023
Structure
?
Aligned Rows:
PubMed ReferencesClick to see Conserved Features Help

Sequence Alignment
?
Format: Row Display: Color Bits: Type Selection:
WP_178887764       3 ILSILATVVLLGALFYHRVSLFISSLIVLAWTAALGVAGLWSAWVLVPLAIILVPFNFAPMRKSMISAPVFRGFRKVMPP 82  Escherichia...
9_ncbifamImport    1 LLWTLAMLFVLGALTYLRVSLLTSSFIAAIVLTIGTAAEAVSPLTWIIFLVIALPLNISSFRKNFLTKPMLKMYRGIMPE 80 
19_ncbifamImport   1 LLWILAFLFVLGALAYLRVSLLTSSIIAAVVMAIGTATEVVSPLSWIIFLIVALPLNVSAFRKNFLTKPILKIYRGIMPE 80 
8_ncbifamImport    1 LLWILAMIFTIGAFAYLRVALLTATLGTAIVLAIGTGAASLSPLLWVVFLAIALPLNVSSFRQNVISRSLLKMYRGIMPE 80 
5_ncbifamImport    1 LLWIIAMILVLGALAYLRVSLLTATIAAAVVMTAGWTLDVVGPISWIVFLVIALPLNISAFRQNVISRPLMKIYRGIMPE 80 
24_ncbifamImport   1 LLWIIAMILVLGAMAYLRVSLLTATLGALVVMAVGSATEIVNTTAWIVFLVVALPFNIKSFRQQFISRPLMKVYRGIMPE 80 
26_ncbifamImport   1 LLWIIAMIFVLGAMAYLRVSLLSTTIAAAIVLVVGSTLDIIGVITWIVFLVIALPLNIKSFRQNFISRPLIKVYRGIMPE 80 
28_ncbifamImport   1 LLWSIALLVVLGACAYLRVSLLTATAAAAIMLTAGWTLDVVGLWGGIIFLIIALPLNISSIRQSLITRPLLKVYRGIMPE 80 
22_ncbifamImport   1 IIWLIVALTLTWFMSYTRASLSSFTLCFAALMALGSLFNIIGIVSWLLFAVIALPINIDNIRQQFISMPLLAIFKKIMPQ 80 
10_ncbifamImport   1 FIWFLLVVLTLAVASYQRTSLVTAVAIGAGVMILGTLFGDIGLLGWVVFLALTLPFTLANIRQQYISKKLLAFYRKVMPE 80 
WP_178887764      83 MSRTEKEAIDAGTTWWEGDLFQGKPDWKKLHNYPQPRLTAEEQAFLDGPVEEACRMANDFQITHELADLPPELWAYLKEH 162 Escherichia...
9_ncbifamImport   81 MSSTEKEAIEAGTTWWDADIFAGKPDWQKLHNYPAARLTAEEQAFLDGPVEEVCKMLNQHQVSHELGDLPQEIWQYLKDH 160
19_ncbifamImport  81 MSSTEKEAIEAGTTWWEADLFAGNPDWKKLHNYPVARMSADEQAFLDGPVEEVCKMLNQHQVSHQLGDLPPEIWQYLKDN 160
8_ncbifamImport   81 MSSTEKEAIEAGTTWWEADLFAGKPDWSKLHNYPKASLTAEEQAFLDGPVEEVCRMVNQHQVSHELADLPDEVWQYLKDH 160
5_ncbifamImport   81 MSSTEKEAIEAGTTWWEADLFSGNPNWKKLHNYPVARLSADEQAFLDGPVEEVCRMVNQHQVSHQLADLPAEVWQYLKDH 160
24_ncbifamImport  81 MSSTEKEAIEAGTTWWEADLFAGNPNWSKLHNYPQARLTADEQAFLDGPVETVCAMLNQHQVSHQLADLPQDVWQYLKDN 160
26_ncbifamImport  81 MSSTEKEAIEAGTTWWEADLFAGNPNWSKLHNYPKARLTADEQAFIDGPVEEVCKMLNQHEVSHVLGDLPQDVWQFLKDH 160
28_ncbifamImport  81 MSSTEKEAIDAGTTWWEADLFAGNPNWKKLHNYPTARLSAEEQAFIDGPVNEVCRMVNEHQVSHQFADLPADVWQYLKDN 160
22_ncbifamImport  81 MSSTEQEAIDAGTTWFDADLFRGDPDWLKLHNYPRPRLSSQEKAFLDGPVEQVCAMVNDWHITHEIADLPPEIWQFLKEN 160
10_ncbifamImport  81 MSSTEQEAIDAGTVWWDGDIFSGKPDWDKLHRIPKGRLTAEEQAFLDGPCDKVCSMVDEWQINHKDADLPPEIWQFLKEH 160
WP_178887764     163 RFFAMIIKKEYGGLEFSAYAQSRVLQKLSGVSGILAITVGVPNSLGPGELLQHYGTDEQKDHYLPRLARGQEIPCFALTS 242 Escherichia...
9_ncbifamImport  161 GFFAMIIKKKYGGLEYSAYAQSRVLQKLAGVSSELASTVGVPNSLGPGELLQHYGTPAQQDHYLPRLAKGLEVPCFALTS 240
19_ncbifamImport 161 GFFAMIIKKKYGGLEYSAYAQSRVLQKLAGLSSELASTVGVPNSLGPGELLQHYGTTEQQDHYLPRLAQGLEVPCFALTS 240
8_ncbifamImport  161 GFFAMIIKKKYGGLEYSAYAQSRVLQKLAGLSSELASTVGVPNSLGPGELLQHYGTPAQQDHYLPRLAKGLEVPCFALTS 240
5_ncbifamImport  161 GFFAMIIKKKYGGLEYSAYAQSRVLQKLAGVSSELASTVGVPNSLGPGELLQHYGTPEQQNHYLPRLAKGLEVPCFALTS 240
24_ncbifamImport 161 GFFAMIIKKKYGGLEYSAYAQSRVLQKLAGVSSELASTVGVPNSLGPGELLQHYGTTEQQDHYLPRLAKGLEVPCFALTS 240
26_ncbifamImport 161 GFFAMIIKKKYGGLEYSAYAQSCVLQKLAGVSSELASTVGVPNSLGPGELLQHYGTKEQQDHYLPRLAQGLEVPCFALTS 240
28_ncbifamImport 161 GFFAMIIKKKYGGLEFSAYAQSRVLQKLAGVSSELASTVGVPNSLGPGELLQHYGTAEQQDHYLPRLAKGLEVPCFALTS 240
22_ncbifamImport 161 KFFAMIIKKQYGGLEFSAYAQSRVLQKLTGVSSVLASTVGVPNSLGPGELLQEYGTKEQQDYYLPRLAKGEEIPCFALTS 240
10_ncbifamImport 161 KFFAMIIKKEYGGLAFSAYAQSRVLQKLAGVSAVLSSTVGVPNSLGPGELLQHYGTKEQQDHYLPRLAAGEEIPCFALTG 240
WP_178887764     243 PEAGSDAGAIPDTGIVCMGEWQGQQVLGMRLTWNKRYITLAPIATVLGLAFKLSDPEKLLGGAEDLGITCALIPTTTPGV 322 Escherichia...
9_ncbifamImport  241 PEAGSDAGAIPDFGIVCKGQWEGEEVLGMKLTWNKRYITLAPVATVLGLAFKLQDPDKLLGDKEELGITCALIPTDIDGV 320
19_ncbifamImport 241 PEAGSDAGSIPDFGIVCKGQWEGEEILGMKLTWNKRYITLAPVATVLGLAFKLRDPDQLLGDKAELGITCALIPTDMEGV 320
8_ncbifamImport  241 PEAGSDAGAIPDYGVVCKGEWEGEEVLGMKLTWNKRYITLAPTATVLGLAFKLRDPDQLLGNQEELGITCALIPTDIEGV 320
5_ncbifamImport  241 PEAGSDAGSIPDFGIVCKGQWEGEEVLGMKLTWNKRYITLAPVATVLGLAFKLRDPDHLLGDKEELGITCALIPTDVEGV 320
24_ncbifamImport 241 PEAGSDAGAIPDFGIVCKGEWEGEEVLGMKLTWNKRYITLAPVATVLGLAFKLRDPDHLLGETEELGITCALIPTDVEGV 320
26_ncbifamImport 241 PEAGSDAGSIPDFGVVCKGEFQGEEVLGMKLTWNKRYITLAPVATVLGLAFKLRDPDHLLGDKEELGITCALIPTDIPGV 320
28_ncbifamImport 241 PEAGSDAGSIPDYGVVCKGMWKGEEVLGMKLTWNKRYITLAPIATVLGLAFKLRDPERLLGGEEELGITCALIPTDVEGV 320
22_ncbifamImport 241 PEAGSDAGSIPDYGVICHGQFNGEDVLGMKLTWDKRYITLAPIATVLGLAFKLQDPDNLLSEQEDLGITCALIPTDIEGI 320
10_ncbifamImport 241 PEAGSDAGAIPDVGVVCKGEWNGEEVLGMRLTFNKRYITLAPVATVIGLAFKLQDPEGLLGDNKEPGITCALIPRDTKGL 320
WP_178887764     323 EIGRRHFPLNVPFQNGPTRGKDVFVPIDYIIGGPKMAGQGWRMLVECLSVGRGITLPSNSTGGVKSVALATGAYAHIRRQ 402 Escherichia...
9_ncbifamImport  321 ETGRRHFPLNCMFQNGPTRGNEVFVPLSFIIGGPEMAGQGWRMLVECLSVGRGITLPSNSAGGIKTAAVATGAYARIRRQ 400
19_ncbifamImport 321 ETGRRHFPLNCMFQNGPTRGNEVFVPLSFIIGGPEMAGQGWRMLVECLSVGRGITLPSNSAGGIKIAAVATGAYARIRRQ 400
8_ncbifamImport  321 ETGRRHFPLNCMFQNGPTRGTDVFVPLSFIIGGVEMAGQGWRMLVECLSVGRGITLPSNSAGGIKTAAVATGAYARIRRQ 400
5_ncbifamImport  321 ETGRRHFPLNCMFQNGPTRGNEVFVPLSFIIGGPKMAGQGWRMLVECLSVGRGITLPSNSAGGVKTAALATGAYARIRRQ 400
24_ncbifamImport 321 ITGRRHFPLNCMFQNGPTQGNEVFVPLSFIIGGPKMAGQGWRMLVECLSVGRGITLPSNSAGGIKTAALATGAYARIRRQ 400
26_ncbifamImport 321 ETGRRHFPLNCMFQNGPTRGNEVFVPLSFIIGGPEMAGQGWRMLVECLSVGRGITLPSNSAGGVKTAAVATGAYARIRRQ 400
28_ncbifamImport 321 ETGRRHFPLNCMFQNGPTRGKDVFVPLSFIIGGPKMAGQGWRMLVECLSVGRGITLPSNSAGGVKTAALATGAYARIRRQ 400
22_ncbifamImport 321 TIGRRHFPLNVPFQNGPTQGKDVFVPLDFIIGGSDMAGQGWRMLVECLSVGRAITLPSNSTGGVKTAALATGAYSRIRRQ 400
10_ncbifamImport 321 EIGRRHLPLNTPFQNGPIKGEDIFVPIDYIIGGPQMAGRGWRMLVECLSVGRCITLPSSAAGGAKSVSLATGAYARIRRQ 400
WP_178887764     403 FKISIGKMEGIEEPLARIAGNAYVMDAAASLITYGIMLGEKPAVLSAIVKYHCTHRGQQSIIDAMDITGGKGIMLGQSNF 482 Escherichia...
9_ncbifamImport  401 FKLPIGKLEGIEEPMARIGGNAYLMEAVTSLTTTGIDLGEKPSVISAIVKFHLTDRMQKCVIDAMDIHGGKGVCLGPNNY 480
19_ncbifamImport 401 FKLPIGKLEGIEEPMARIGGNAYLMDAVTSLTTTGIDLGEKPSVISAIVKFHLTDRMQKCVIDAMDIHGGKGVCLGPNNY 480
8_ncbifamImport  401 FKLPIGKLEGIEEPMARIGGNAYLMDAVTTLTTTAIDLGEKPSVISAIVKYHLTDRMQRCVIDAMDIHGGKGVCLGPNNY 480
5_ncbifamImport  401 FKLPIGKLEGIEEPMARIGGNAYLMDAVTSLTTTGIDLGEKPSVISAIVKYHLTDRMQKCIIDAMDIHGGKGVCLGPNNY 480
24_ncbifamImport 401 FKLPIGKLEGIEEPMARIGGNAYLMDAVTSLTTTGIDLGEKPSVISAIVKFHLTDRMQKCVIDAMDIHGGKGVCLGPNNY 480
26_ncbifamImport 401 FKLPIGKLEGIEEPMARLGGNAYLMDAVATLTTTAIDLGEKPSVVSAIVKFHLTDRMQKCVIDAMDIHGGKGVCLGPNNY 480
28_ncbifamImport 401 FKLPIGKLEGIEEPMARIGGNAYLMDAVTSLTTTGIDLGEKPSVISAIVKYHLTDRMQKCVIDAMDIHGGKGVCLGPNNY 480
22_ncbifamImport 401 FKMPIGKMEGIEEPLARIGANAYLMDAVTTMSTGAIDLGEKPSVISAIAKYHLTEKMRSSIIDAMDIHGGKGICMGPNNY 480
10_ncbifamImport 401 FRMPVGHMEGVEEMLARIGGNAYLMDGVTRFSTVGVDLGEKPSVISAICKYHLTEKMRQVINDAMDVHGGKGVMLGPNNY 480
WP_178887764     483 LARAYQGAPIAITVEGANILTRSMMIFGQGAIRCHPYVLEEMEAAKNND----VNAFDKLLFKHIGHVGSNKVRSFWLGL 558 Escherichia...
9_ncbifamImport  481 LGRGYQAAPIAITVEGANILTRSMIIYGQGAIRCHPYVLAEMESAFDTDaekgLNDFDAAIFGHIGFTASNLVRSFWLGL 560
19_ncbifamImport 481 LGRGYQAAPIAITVEGANILTRSMIIYGQGAIRCHPYVITEMESAFDTDanrgLDTFDAAIFGHIGFAISNLVRSFWLGV 560
8_ncbifamImport  481 LGRGYQAAPIAITVEGANILTRSMIIYGQGAIRCHPYVLAEMESAFDPDankgLRDFDAAIFGHIGFTTSNLVRSLWMGL 560
5_ncbifamImport  481 LGRGYQAAPIAITVEGANILTRSMIIYGQGAIRCHPYVLAEMESAFDTQsgqgLANFDAAIFGHIGFATSNFVRSFWLGL 560
24_ncbifamImport 481 LGRGYQAAPIAITVEGANILTRAMIIYGQGAIRCHPYVLTEMESAFDTEsgqgLANFDAAIFGHIGFAISNFIRSFWMGL 560
26_ncbifamImport 481 LGRGYQAAPIAITVEGANILTRSMIIYGQGAIRCHPYVLAEMESAFDTDanrgLANFDAAIFGHIGFATSNFIRSFWMGL 560
28_ncbifamImport 481 LGRGYQAAPIAITVEGANILTRSMIIYGQGAIRCHPYVLAEMDSAFDKDvrqgLNKFDAALFGHIGFTISNLIRSVWMGL 560
22_ncbifamImport 481 LARGYQGAPIAVTVEGANILTRSMIIYGQGAIRCHPYVLAELEAANNSDneqaLNDFDHALFGHIGFSLSNISRSLWCSI 560
10_ncbifamImport 481 LGRGYQGVPVSITVEGANILTRNMMIFGQGAMRCHPYVLKEIEAASIEDkkeaLQAFDKAVFGHIGFAVANTVRSIWFSL 560
WP_178887764     559 TRGLTSSTPTGDATKRYYQHLNRLSANLALLSDVSMAVLGGSLKRRERISARLGDILSQLYLASAVLKRYDDEGRNEADL 638 Escherichia...
9_ncbifamImport  561 TSSRFSNAPYSDKTKRYYQHMNRFSANLALLSDLAMATLGGDLKRKERISARLGDLLSQLYLSSATLKRYQDEGRQTEDL 640
19_ncbifamImport 561 TSSRFSNAPYSDKTKRYYQQMNRFSANLALLSDMAMATLGGELKRKERISARLGDLLSQLYLTSATLKRYQDEGRQTEDL 640
8_ncbifamImport  561 TSSYFSNAPYADKTKRYYQQMNRFSANLALLSDLAMATLGGNLKRKERISARLGDLLSQLYLASATLKRYEDEGRLTEDL 640
5_ncbifamImport  561 TSSRFSNAPYSDKTKRYYQHMNRFSANLALLSDLAMATLGGNLKRKERISARLGDLLSQLYLASATLKRYEDEGRQTDDL 640
24_ncbifamImport 561 TSSRFTNSPYSDKTKRYYQQMNRFSANLALLSDLAMATLGGNLKRKERISARLGDLLSQLYLASATLKRYQDEGRLVEDL 640
26_ncbifamImport 561 TSSRFSNSPYSDKTKRYYQQMNRFSANLALLSDLAMATLGGNLKRKERISARLGDLLSQLYLTSATLKRYEDDGRLTEDL 640
28_ncbifamImport 561 TGSRFSNAPYGDKTKRYYQHMNRFSANLALLSDLAMATLGGNLKRKERISARLGDMLSQLYLASATLKRYQDEGRQTEDL 640
22_ncbifamImport 561 TGSRFLGSPYDDGTRRYYQLLTRFSANLAMLSDISMLSLGADLKRKERISARLGDVLSQLYLASATLKRYNDEGRNTADL 640
10_ncbifamImport 561 TNGAFSSAPFTDETARYYKLLQGYSANLALLTDVSMGVLGGDLKRRERLSARLGDILSGLYMGSTTLKRFDEEGRLKEDL 640
WP_178887764     639 PLVHWGVQDALYQAEQAMDDLLQNFPNRVVAGLLNVVIFPTGRHYLAPSDKLDHKVAKILQVPNATRSRIGRGQYLTPSE 718 Escherichia...
9_ncbifamImport  641 ALVQWAVEDSLYKLQDSLDDLLDNFPMGL-GRVLRVIMFPFGRPLKRPSDILDHKVAKIMQTPCASRDRLAKGQFLTACE 719
19_ncbifamImport 641 PLVQWAVEDSLYKLQDSLDDLLNNFPMGL-GFVLRGIIFPFGRPLKRPSDVLDHKVATIMQTPCASRDRLGKGQFWTPCE 719
8_ncbifamImport  641 PLVQWAVEDALYKLQSSLDDLLDNFPMGL-GIALRVIIFPFGRPLKRPSDVLDHKVAKIMQTPCASRERLGKGQFWTPSE 719
5_ncbifamImport  641 PLVQWAVEDALYKLQASLDDLLDNFPMGL-GGVLRVVMFPFGRPLKRPSDVLDHKVAKIMQTPCESRDRLGKGQFWTNSE 719
24_ncbifamImport 641 PLVQWAVEDSLHKLQTALDELLDNFPMGL-GPVLRVVIFPFGRPLKRPSDVLDHKVAQIMQTPCASRERLGQGQYWTASQ 719
26_ncbifamImport 641 PLVQWAVEDSLYKLQDSLDDLLNNFPMGL-GIALRAVIFPFGRPIKRPSDVLDHKVAKIMQTPCASRDRLGKGQFWTASE 719
28_ncbifamImport 641 PLVQWAVEDALFKLQASLDELLDNFPAGL-GGVLRVLLLPFGRPLKRPSDVLDHKVAKIMQTPCASRERLGQGQFWEACD 719
22_ncbifamImport 641 PLVQWAVEDCLYNIQHAIDELISNFPNKIVGKLLRVIIFPLGTWLKKPNDETSHKVAQLLQTPGSARTRLGQGQYLTRDG 720
10_ncbifamImport 641 PLLHWAMQTTLHDIETAIDDFLANFPNRAIAAALRVMVIPFGRRIGKPSDKTEHAIAKMLQTPSTARSRLGYGQYLTREE 720
WP_178887764     719 HNPVGLLEEALVDVIAADPIHQRICKELGKNLPFTRLDELAHNALVKGLIDKDEAAILVKAEESRLRSINVDDFDPEELA 798 Escherichia...
9_ncbifamImport  720 NNPVGIQEQTFKDIIACEPLHDKVCKAAGKRLPFIWLDKVAAEGKALGILSEDEISLLERTEIGRMKSINVDDFDPDELK 799
19_ncbifamImport 720 NNPVGVQEQTFKDILACEPLHAKVSKAAGKRIPFMWLDKIAAQGKALGVLTDEEVALLERAEIGRMKSINVDDFDPDELK 799
8_ncbifamImport  720 HNAVGIQEQTFKDIIASEPIYDKVCKAAGKRLPFMWLDKIAAEGKALGVLSEEEVALLERAEIGRMKSINVDDFDHEELK 799
5_ncbifamImport  720 HNAVGIQEQTLKDILAAEPLFDKVCKASGKRLPFMWLDKVAAEGKALGVLSDSEIQLLERAEIGRMKSINVDDFDPAELR 799
24_ncbifamImport 720 YNPVGIQEQTFKDILAAEPLYDKVCKASGKRLPFMWLDKVAAEGRALGVLSDSEIALLERAEIGRMKSVNVDDFAPEELQ 799
26_ncbifamImport 720 FNAVGIQEQTFKDILAAEPLYDKVCKAAGKRLPFMWLDKVAAEGKALGVLSDSEIALLERAEIGRLKSINVDDFDTDELR 799
28_ncbifamImport 720 NNPVGVQEQTFKDILAAEPLYDKVCKAAGKRLPFMWLDQVAAEGKALGILSDAEIALLEKAEIGRMKSINVDDFDPAELV 799
22_ncbifamImport 721 NNIFGRLEQVLEDIISCEPIYEKVCRELNKKLPFYHLDKVAELGLTNNIISKVEAELLTTAEVGRQWVIAVDDFDSKDMT 800
10_ncbifamImport 721 GSLFGDLEQTLDDVLASEPIFERICKHKKAKLPFTRLDTLADEALAEEVINEEEANLLRKTEAGRLRTINVDDFDHEELV 800
WP_178887764     799 TKPVKLPEK-VRKVEAA 814 Escherichia coli
9_ncbifamImport  800 AM--VVAK--TKHEQAA 812
19_ncbifamImport 800 AM--AIGK--QSHEQAA 812
8_ncbifamImport  800 AR--TLEY--TKEVQAA 812
5_ncbifamImport  800 PE--VVSA--TSQERAA 812
24_ncbifamImport 800 AQ--VVKA--AKQVKAA 812
26_ncbifamImport 800 AQ--LAPK--AKQEKAA 812
28_ncbifamImport 800 AQ--TTTG--KSQEQAA 812
22_ncbifamImport 801 A-----------FSGSA 806
10_ncbifamImport 801 AKVNSTSATkKRGGKAA 817
| Disclaimer | Privacy statement | Accessibility |
NCBI Home NCBI Search NCBI SiteMap